Durante l'alto medioevo le sorti dell'area furono legate alla città di Heraclia, sede vescovile e prima capitale del Ducato di Venezia.Terminata la guerra tra la Serenissima e il Regno d'Ungheria, la Repubblica incentivò lo sviluppo del territorio offrendo esenzioni fiscali agli agricoltori del luogo.                                                                                                                                                                                             Nel 1797 con l'annessione di Venezia e delle sue dipendenze al Regno d'Italia napoleonico fu creato il Dipartimento dell'Adriatico, di cui San Donà entrò a far parte come capoluogo.Con l'annessione del Veneto al Regno d'Italia, nuovi lavori di bonifica interessarono il sandonatese, segnando la metamorfosi ambientale del territorio e incrementando la produttività della zona.                                                                                                                                                                                                         Nel 1944 la città fu sottoposta a diversi bombardamenti: durante le incursioni aeree vennero distrutti il Teatro Verdi e l'Ospedale Umberto I. Il 25 aprile 1945,, venne proclamata l'insurrezione della città e nella stessa giornata San Donà fu liberata.